Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNEQ04844 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms