Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC25A11Q02978 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms