Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms