Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD83Q01151 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD83Q01151 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD83Q01151 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD83Q01151 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD83Q01151 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD83Q01151 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms