Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms