Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSF1Q00613 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms