Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX3P78415 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX3P78415 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX3P78415 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX3P78415 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX3P78415 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX3P78415 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX3P78415 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX3P78415 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX3P78415 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX3P78415 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX3P78415 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX3P78415 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX3P78415 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX3P78415 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX3P78415 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX3P78415 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX3P78415 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX3P78415 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX3P78415 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX3P78415 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX3P78415 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX3P78415 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX3P78415 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX3P78415 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX3P78415 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX3P78415 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX3P78415 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX3P78415 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX3P78415 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX3P78415 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX3P78415 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX3P78415 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX3P78415 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX3P78415 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX3P78415 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX3P78415 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX3P78415 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX3P78415 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX3P78415 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX3P78415 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX3P78415 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX3P78415 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX3P78415 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX3P78415 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX3P78415 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX3P78415 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX3P78415 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX3P78415 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX3P78415 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX3P78415 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX3P78415 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX3P78415 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX3P78415 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX3P78415 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX3P78415 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX3P78415 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX3P78415 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX3P78415 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX3P78415 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX3P78415 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX3P78415 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX3P78415 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX3P78415 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX3P78415 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX3P78415 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX3P78415 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX3P78415 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX3P78415 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX3P78415 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX3P78415 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX3P78415 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX3P78415 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX3P78415 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX3P78415 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX3P78415 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX3P78415 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX3P78415 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX3P78415 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX3P78415 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX3P78415 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX3P78415 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX3P78415 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX3P78415 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX3P78415 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX3P78415 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX3P78415 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX3P78415 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX3P78415 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX3P78415 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX3P78415 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX3P78415 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX3P78415 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX3P78415 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX3P78415 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX3P78415 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX3P78415 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX3P78415 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX3P78415 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX3P78415 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms