Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms