Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms