Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO4P61968 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO4P61968 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO4P61968 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO4P61968 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO4P61968 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO4P61968 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO4P61968 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO4P61968 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO4P61968 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO4P61968 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO4P61968 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO4P61968 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO4P61968 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO4P61968 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO4P61968 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO4P61968 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO4P61968 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO4P61968 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO4P61968 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO4P61968 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO4P61968 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO4P61968 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO4P61968 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO4P61968 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO4P61968 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO4P61968 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO4P61968 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO4P61968 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO4P61968 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO4P61968 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO4P61968 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO4P61968 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO4P61968 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO4P61968 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO4P61968 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO4P61968 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO4P61968 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO4P61968 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO4P61968 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO4P61968 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO4P61968 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO4P61968 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO4P61968 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO4P61968 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO4P61968 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO4P61968 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO4P61968 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO4P61968 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO4P61968 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO4P61968 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO4P61968 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO4P61968 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO4P61968 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO4P61968 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO4P61968 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO4P61968 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO4P61968 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO4P61968 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO4P61968 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO4P61968 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO4P61968 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO4P61968 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO4P61968 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO4P61968 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO4P61968 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO4P61968 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO4P61968 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO4P61968 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO4P61968 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO4P61968 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO4P61968 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO4P61968 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO4P61968 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO4P61968 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO4P61968 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO4P61968 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO4P61968 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO4P61968 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO4P61968 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO4P61968 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO4P61968 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO4P61968 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMO4P61968 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO4P61968 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO4P61968 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO4P61968 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO4P61968 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO4P61968 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO4P61968 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO4P61968 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO4P61968 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO4P61968 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO4P61968 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO4P61968 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO4P61968 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO4P61968 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO4P61968 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO4P61968 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO4P61968 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms