Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UFM1P61960 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UFM1P61960 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UFM1P61960 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
UFM1P61960 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UFM1P61960 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UFM1P61960 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UFM1P61960 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UFM1P61960 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UFM1P61960 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UFM1P61960 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UFM1P61960 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UFM1P61960 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UFM1P61960 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UFM1P61960 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UFM1P61960 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UFM1P61960 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UFM1P61960 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UFM1P61960 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UFM1P61960 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UFM1P61960 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UFM1P61960 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UFM1P61960 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UFM1P61960 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UFM1P61960 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UFM1P61960 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UFM1P61960 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UFM1P61960 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UFM1P61960 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UFM1P61960 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UFM1P61960 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UFM1P61960 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UFM1P61960 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UFM1P61960 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UFM1P61960 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UFM1P61960 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms