Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms