Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK1P57059 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK1P57059 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIK1P57059 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK1P57059 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK1P57059 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK1P57059 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK1P57059 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK1P57059 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK1P57059 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK1P57059 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK1P57059 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK1P57059 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK1P57059 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK1P57059 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK1P57059 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK1P57059 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK1P57059 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK1P57059 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK1P57059 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK1P57059 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK1P57059 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK1P57059 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK1P57059 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIK1P57059 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIK1P57059 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIK1P57059 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SIK1P57059 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SIK1P57059 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIK1P57059 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIK1P57059 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIK1P57059 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIK1P57059 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIK1P57059 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIK1P57059 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIK1P57059 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIK1P57059 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIK1P57059 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIK1P57059 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIK1P57059 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIK1P57059 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIK1P57059 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SIK1P57059 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIK1P57059 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SIK1P57059 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIK1P57059 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SIK1P57059 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIK1P57059 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIK1P57059 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIK1P57059 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIK1P57059 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIK1P57059 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK1P57059 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK1P57059 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK1P57059 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK1P57059 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK1P57059 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK1P57059 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK1P57059 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK1P57059 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK1P57059 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK1P57059 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK1P57059 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK1P57059 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK1P57059 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK1P57059 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK1P57059 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK1P57059 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK1P57059 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK1P57059 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK1P57059 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIK1P57059 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK1P57059 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK1P57059 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK1P57059 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK1P57059 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK1P57059 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK1P57059 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK1P57059 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK1P57059 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK1P57059 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK1P57059 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK1P57059 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK1P57059 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK1P57059 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK1P57059 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK1P57059 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK1P57059 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK1P57059 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK1P57059 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIK1P57059 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK1P57059 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK1P57059 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK1P57059 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK1P57059 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK1P57059 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK1P57059 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK1P57059 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK1P57059 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK1P57059 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms