Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN8P56748 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN8P56748 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms