Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX9P55771 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PAX9P55771 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAX9P55771 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms