Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP12AP54707 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms