Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSRP3P50461 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms