Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms