Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP153P49790 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP153P49790 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP153P49790 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP153P49790 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP153P49790 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP153P49790 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP153P49790 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP153P49790 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP153P49790 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP153P49790 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP153P49790 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP153P49790 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP153P49790 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP153P49790 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP153P49790 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP153P49790 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP153P49790 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP153P49790 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP153P49790 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP153P49790 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP153P49790 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP153P49790 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP153P49790 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP153P49790 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP153P49790 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP153P49790 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP153P49790 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP153P49790 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP153P49790 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP153P49790 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP153P49790 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP153P49790 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP153P49790 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP153P49790 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP153P49790 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP153P49790 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP153P49790 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP153P49790 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP153P49790 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP153P49790 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP153P49790 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP153P49790 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP153P49790 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP153P49790 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP153P49790 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP153P49790 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP153P49790 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP153P49790 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP153P49790 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP153P49790 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP153P49790 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP153P49790 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP153P49790 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP153P49790 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP153P49790 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP153P49790 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP153P49790 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP153P49790 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP153P49790 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP153P49790 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP153P49790 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP153P49790 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP153P49790 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP153P49790 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP153P49790 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
NUP153P49790 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NUP153P49790 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NUP153P49790 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NUP153P49790 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NUP153P49790 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NUP153P49790 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NUP153P49790 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NUP153P49790 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
NUP153P49790 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NUP153P49790 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NUP153P49790 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
NUP153P49790 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NUP153P49790 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NUP153P49790 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NUP153P49790 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NUP153P49790 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NUP153P49790 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NUP153P49790 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP153P49790 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP153P49790 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP153P49790 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP153P49790 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP153P49790 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP153P49790 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP153P49790 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP153P49790 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP153P49790 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP153P49790 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP153P49790 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP153P49790 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP153P49790 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP153P49790 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP153P49790 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP153P49790 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms