Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGM4P49221 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGM4P49221 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGM4P49221 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TGM4P49221 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM4P49221 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM4P49221 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM4P49221 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM4P49221 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM4P49221 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM4P49221 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM4P49221 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM4P49221 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM4P49221 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM4P49221 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM4P49221 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM4P49221 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM4P49221 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM4P49221 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM4P49221 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM4P49221 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGM4P49221 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms