Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IQGAP1P46940 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IQGAP1P46940 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IQGAP1P46940 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IQGAP1P46940 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IQGAP1P46940 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IQGAP1P46940 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.52■■■□□ 2
IQGAP1P46940 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.52■■■□□ 2
IQGAP1P46940 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IQGAP1P46940 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IQGAP1P46940 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IQGAP1P46940 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IQGAP1P46940 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IQGAP1P46940 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IQGAP1P46940 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
IQGAP1P46940 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IQGAP1P46940 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IQGAP1P46940 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IQGAP1P46940 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms