Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP5P45974 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP5P45974 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP5P45974 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP5P45974 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP5P45974 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP5P45974 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP5P45974 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP5P45974 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP5P45974 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP5P45974 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP5P45974 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP5P45974 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP5P45974 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP5P45974 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP5P45974 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP5P45974 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP5P45974 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP5P45974 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP5P45974 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP5P45974 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP5P45974 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP5P45974 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP5P45974 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP5P45974 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP5P45974 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP5P45974 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP5P45974 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP5P45974 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP5P45974 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP5P45974 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP5P45974 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP5P45974 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP5P45974 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP5P45974 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP5P45974 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP5P45974 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP5P45974 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP5P45974 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP5P45974 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP5P45974 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP5P45974 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP5P45974 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP5P45974 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP5P45974 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP5P45974 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP5P45974 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP5P45974 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP5P45974 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP5P45974 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP5P45974 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP5P45974 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP5P45974 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP5P45974 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP5P45974 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP5P45974 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP5P45974 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP5P45974 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP5P45974 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP5P45974 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP5P45974 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP5P45974 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP5P45974 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP5P45974 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP5P45974 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP5P45974 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP5P45974 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP5P45974 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP5P45974 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP5P45974 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP5P45974 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP5P45974 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP5P45974 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP5P45974 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP5P45974 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP5P45974 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP5P45974 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP5P45974 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP5P45974 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP5P45974 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP5P45974 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP5P45974 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP5P45974 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP5P45974 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP5P45974 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP5P45974 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP5P45974 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP5P45974 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP5P45974 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP5P45974 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP5P45974 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP5P45974 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP5P45974 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP5P45974 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP5P45974 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP5P45974 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP5P45974 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP5P45974 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP5P45974 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP5P45974 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms