Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NF2P35240 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NF2P35240 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NF2P35240 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NF2P35240 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NF2P35240 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NF2P35240 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NF2P35240 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NF2P35240 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NF2P35240 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NF2P35240 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NF2P35240 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NF2P35240 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NF2P35240 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NF2P35240 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NF2P35240 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NF2P35240 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NF2P35240 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NF2P35240 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NF2P35240 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NF2P35240 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NF2P35240 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NF2P35240 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NF2P35240 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NF2P35240 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NF2P35240 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NF2P35240 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NF2P35240 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NF2P35240 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NF2P35240 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NF2P35240 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NF2P35240 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NF2P35240 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NF2P35240 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NF2P35240 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NF2P35240 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NF2P35240 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NF2P35240 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NF2P35240 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NF2P35240 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NF2P35240 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NF2P35240 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NF2P35240 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NF2P35240 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NF2P35240 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NF2P35240 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NF2P35240 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NF2P35240 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NF2P35240 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NF2P35240 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NF2P35240 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NF2P35240 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NF2P35240 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NF2P35240 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NF2P35240 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NF2P35240 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NF2P35240 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NF2P35240 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NF2P35240 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NF2P35240 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NF2P35240 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NF2P35240 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NF2P35240 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NF2P35240 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NF2P35240 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NF2P35240 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NF2P35240 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NF2P35240 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NF2P35240 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NF2P35240 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NF2P35240 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NF2P35240 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NF2P35240 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NF2P35240 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NF2P35240 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NF2P35240 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NF2P35240 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NF2P35240 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NF2P35240 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NF2P35240 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NF2P35240 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NF2P35240 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NF2P35240 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NF2P35240 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NF2P35240 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NF2P35240 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NF2P35240 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NF2P35240 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NF2P35240 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NF2P35240 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NF2P35240 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NF2P35240 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NF2P35240 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NF2P35240 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NF2P35240 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NF2P35240 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NF2P35240 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NF2P35240 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NF2P35240 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NF2P35240 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms