Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA5P31644 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA5P31644 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms