Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms