Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA9P31269 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms