Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGB2P26583 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms