Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms