Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTLA4P16410 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms