Protein–RNA interactions for Protein: P15170

GSPT1, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSPT1P15170 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GSPT1P15170 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms