Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM27P14373 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms