Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf89P0DMQ9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms