Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms