Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PF4P02776 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PF4P02776 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PF4P02776 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PF4P02776 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PF4P02776 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PF4P02776 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PF4P02776 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PF4P02776 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PF4P02776 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PF4P02776 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PF4P02776 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PF4P02776 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PF4P02776 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PF4P02776 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PF4P02776 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PF4P02776 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PF4P02776 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PF4P02776 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PF4P02776 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PF4P02776 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PF4P02776 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PF4P02776 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PF4P02776 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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