Protein–RNA interactions for Protein: P00746

CFD, Complement factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP00746 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFDP00746 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFDP00746 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFDP00746 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFDP00746 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFDP00746 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFDP00746 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFDP00746 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFDP00746 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFDP00746 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFDP00746 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFDP00746 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFDP00746 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CFDP00746 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFDP00746 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFDP00746 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFDP00746 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFDP00746 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFDP00746 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFDP00746 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFDP00746 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFDP00746 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFDP00746 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFDP00746 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFDP00746 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFDP00746 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFDP00746 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFDP00746 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CFDP00746 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CFDP00746 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CFDP00746 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CFDP00746 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CFDP00746 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CFDP00746 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CFDP00746 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CFDP00746 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CFDP00746 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CFDP00746 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CFDP00746 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CFDP00746 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CFDP00746 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CFDP00746 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CFDP00746 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CFDP00746 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CFDP00746 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CFDP00746 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CFDP00746 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CFDP00746 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CFDP00746 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CFDP00746 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CFDP00746 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CFDP00746 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CFDP00746 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CFDP00746 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CFDP00746 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CFDP00746 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CFDP00746 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CFDP00746 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CFDP00746 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CFDP00746 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CFDP00746 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CFDP00746 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CFDP00746 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CFDP00746 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CFDP00746 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CFDP00746 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CFDP00746 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CFDP00746 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CFDP00746 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CFDP00746 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms