Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3O95983 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3O95983 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3O95983 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3O95983 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3O95983 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3O95983 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3O95983 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3O95983 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3O95983 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3O95983 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3O95983 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3O95983 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3O95983 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3O95983 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3O95983 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3O95983 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3O95983 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3O95983 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3O95983 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3O95983 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3O95983 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3O95983 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3O95983 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3O95983 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3O95983 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MBD3O95983 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD3O95983 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD3O95983 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD3O95983 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD3O95983 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD3O95983 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD3O95983 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD3O95983 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD3O95983 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD3O95983 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD3O95983 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD3O95983 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD3O95983 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD3O95983 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD3O95983 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3O95983 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3O95983 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3O95983 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3O95983 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3O95983 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3O95983 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3O95983 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3O95983 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3O95983 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3O95983 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3O95983 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3O95983 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3O95983 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3O95983 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3O95983 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3O95983 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3O95983 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3O95983 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3O95983 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3O95983 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3O95983 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3O95983 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3O95983 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3O95983 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3O95983 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3O95983 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD3O95983 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD3O95983 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD3O95983 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD3O95983 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD3O95983 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD3O95983 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD3O95983 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD3O95983 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD3O95983 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD3O95983 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD3O95983 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD3O95983 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD3O95983 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD3O95983 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD3O95983 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD3O95983 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD3O95983 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD3O95983 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD3O95983 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD3O95983 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD3O95983 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD3O95983 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms