Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms