Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms