Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UPP2O95045 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UPP2O95045 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UPP2O95045 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UPP2O95045 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UPP2O95045 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UPP2O95045 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UPP2O95045 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UPP2O95045 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UPP2O95045 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UPP2O95045 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UPP2O95045 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UPP2O95045 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UPP2O95045 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UPP2O95045 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UPP2O95045 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
UPP2O95045 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UPP2O95045 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UPP2O95045 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UPP2O95045 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UPP2O95045 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UPP2O95045 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UPP2O95045 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UPP2O95045 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UPP2O95045 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UPP2O95045 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UPP2O95045 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UPP2O95045 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UPP2O95045 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UPP2O95045 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UPP2O95045 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UPP2O95045 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UPP2O95045 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UPP2O95045 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UPP2O95045 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UPP2O95045 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UPP2O95045 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UPP2O95045 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UPP2O95045 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
UPP2O95045 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UPP2O95045 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UPP2O95045 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UPP2O95045 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UPP2O95045 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UPP2O95045 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UPP2O95045 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UPP2O95045 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UPP2O95045 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UPP2O95045 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UPP2O95045 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UPP2O95045 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UPP2O95045 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UPP2O95045 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UPP2O95045 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UPP2O95045 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UPP2O95045 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UPP2O95045 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UPP2O95045 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UPP2O95045 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UPP2O95045 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
UPP2O95045 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UPP2O95045 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UPP2O95045 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UPP2O95045 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UPP2O95045 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UPP2O95045 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UPP2O95045 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UPP2O95045 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UPP2O95045 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UPP2O95045 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UPP2O95045 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UPP2O95045 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UPP2O95045 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UPP2O95045 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UPP2O95045 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UPP2O95045 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UPP2O95045 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UPP2O95045 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UPP2O95045 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UPP2O95045 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UPP2O95045 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UPP2O95045 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UPP2O95045 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UPP2O95045 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UPP2O95045 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UPP2O95045 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UPP2O95045 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UPP2O95045 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UPP2O95045 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
UPP2O95045 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UPP2O95045 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UPP2O95045 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UPP2O95045 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
UPP2O95045 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UPP2O95045 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UPP2O95045 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UPP2O95045 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UPP2O95045 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UPP2O95045 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UPP2O95045 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms