Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRPM2O94759 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRPM2O94759 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRPM2O94759 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRPM2O94759 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRPM2O94759 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TRPM2O94759 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRPM2O94759 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRPM2O94759 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRPM2O94759 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRPM2O94759 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRPM2O94759 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRPM2O94759 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRPM2O94759 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRPM2O94759 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRPM2O94759 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRPM2O94759 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRPM2O94759 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRPM2O94759 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRPM2O94759 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRPM2O94759 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRPM2O94759 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRPM2O94759 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRPM2O94759 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
TRPM2O94759 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRPM2O94759 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TRPM2O94759 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRPM2O94759 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRPM2O94759 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRPM2O94759 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TRPM2O94759 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRPM2O94759 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRPM2O94759 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRPM2O94759 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRPM2O94759 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRPM2O94759 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRPM2O94759 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TRPM2O94759 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRPM2O94759 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRPM2O94759 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRPM2O94759 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRPM2O94759 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRPM2O94759 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRPM2O94759 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
TRPM2O94759 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRPM2O94759 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRPM2O94759 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRPM2O94759 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRPM2O94759 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRPM2O94759 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRPM2O94759 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRPM2O94759 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRPM2O94759 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRPM2O94759 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRPM2O94759 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRPM2O94759 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRPM2O94759 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRPM2O94759 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRPM2O94759 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TRPM2O94759 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRPM2O94759 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TRPM2O94759 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRPM2O94759 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRPM2O94759 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRPM2O94759 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRPM2O94759 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRPM2O94759 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TRPM2O94759 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRPM2O94759 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRPM2O94759 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRPM2O94759 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRPM2O94759 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRPM2O94759 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRPM2O94759 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRPM2O94759 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
TRPM2O94759 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.51■■■□□ 2
TRPM2O94759 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
TRPM2O94759 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TRPM2O94759 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TRPM2O94759 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
TRPM2O94759 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRPM2O94759 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRPM2O94759 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRPM2O94759 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRPM2O94759 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRPM2O94759 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRPM2O94759 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRPM2O94759 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRPM2O94759 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM2O94759 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM2O94759 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM2O94759 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM2O94759 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM2O94759 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM2O94759 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM2O94759 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM2O94759 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM2O94759 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM2O94759 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM2O94759 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms