Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JRKO75564 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JRKO75564 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JRKO75564 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JRKO75564 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JRKO75564 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JRKO75564 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JRKO75564 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JRKO75564 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JRKO75564 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JRKO75564 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JRKO75564 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
JRKO75564 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JRKO75564 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JRKO75564 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JRKO75564 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JRKO75564 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
JRKO75564 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JRKO75564 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JRKO75564 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
JRKO75564 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
JRKO75564 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JRKO75564 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JRKO75564 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JRKO75564 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JRKO75564 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JRKO75564 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JRKO75564 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
JRKO75564 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JRKO75564 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JRKO75564 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JRKO75564 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JRKO75564 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JRKO75564 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JRKO75564 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JRKO75564 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JRKO75564 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JRKO75564 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JRKO75564 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JRKO75564 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JRKO75564 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JRKO75564 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JRKO75564 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JRKO75564 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JRKO75564 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JRKO75564 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JRKO75564 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JRKO75564 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JRKO75564 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JRKO75564 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JRKO75564 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JRKO75564 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JRKO75564 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JRKO75564 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
JRKO75564 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
JRKO75564 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JRKO75564 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JRKO75564 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JRKO75564 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JRKO75564 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JRKO75564 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
JRKO75564 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
JRKO75564 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
JRKO75564 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JRKO75564 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JRKO75564 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
JRKO75564 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JRKO75564 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms