Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms