Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NBNO60934 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NBNO60934 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NBNO60934 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NBNO60934 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NBNO60934 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NBNO60934 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NBNO60934 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NBNO60934 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NBNO60934 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NBNO60934 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NBNO60934 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NBNO60934 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NBNO60934 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NBNO60934 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NBNO60934 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NBNO60934 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NBNO60934 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NBNO60934 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NBNO60934 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NBNO60934 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NBNO60934 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NBNO60934 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NBNO60934 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NBNO60934 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NBNO60934 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NBNO60934 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NBNO60934 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NBNO60934 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NBNO60934 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NBNO60934 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NBNO60934 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NBNO60934 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NBNO60934 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NBNO60934 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NBNO60934 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NBNO60934 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NBNO60934 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NBNO60934 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NBNO60934 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NBNO60934 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NBNO60934 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NBNO60934 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NBNO60934 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NBNO60934 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NBNO60934 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NBNO60934 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NBNO60934 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NBNO60934 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NBNO60934 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NBNO60934 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NBNO60934 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NBNO60934 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NBNO60934 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NBNO60934 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NBNO60934 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NBNO60934 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NBNO60934 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NBNO60934 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NBNO60934 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NBNO60934 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NBNO60934 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NBNO60934 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NBNO60934 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NBNO60934 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NBNO60934 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NBNO60934 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NBNO60934 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NBNO60934 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NBNO60934 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NBNO60934 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NBNO60934 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NBNO60934 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NBNO60934 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NBNO60934 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NBNO60934 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NBNO60934 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NBNO60934 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NBNO60934 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NBNO60934 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NBNO60934 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NBNO60934 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NBNO60934 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NBNO60934 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NBNO60934 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NBNO60934 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NBNO60934 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NBNO60934 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NBNO60934 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NBNO60934 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NBNO60934 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NBNO60934 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NBNO60934 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NBNO60934 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NBNO60934 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NBNO60934 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NBNO60934 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NBNO60934 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NBNO60934 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NBNO60934 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms