Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms