Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN4O43707 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
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