Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HTRA2O43464 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms