Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms