Protein–RNA interactions for Protein: O15034

RIMBP2, RIMS-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP2O15034 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIMBP2O15034 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIMBP2O15034 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIMBP2O15034 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIMBP2O15034 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIMBP2O15034 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIMBP2O15034 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms