Protein–RNA interactions for Protein: G3V0Z9

LYNX1, HCG2043033, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1G3V0Z9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYNX1G3V0Z9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYNX1G3V0Z9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LYNX1G3V0Z9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms