Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms